日军行动非常迅速，在正太路一线作战的八路军面临敌人强兵反扑压力，有的战区已经与敌展开反击战。

副总指挥面对正太路八路军之现状，命令各部队将任务重点，转移到正太路两侧以及外延敌据点，将深思熟虑中八路军第二阶段的任务，形成一套最终的作战方案。

实施第二阶段任务，命令晋察冀军区以四个团兵力，加快收复上、下社以北日军据点；命令一二零兵团贺部，部署一部兵力，以最迅猛的速度，拔掉深入到根据地腹地的日军据点，把进驻的日军部队赶出根据地；命令一二九兵团以不少于四个团兵力，突袭平、辽公路，彻底破袭毁灭，造成公路瘫痪，收复辽河。

有了第二阶段的实施方案，副总指挥对第一阶段后期，作出明确指示：百团大战已现战果，该部队在正太线坚持时间越长，破袭就越彻底，这将逼迫敌人抽出兵力回援正太路，破坏日军在其他点、线部署，给我军创造在运动中打击敌人。

这样，会迫使日军侵入我根据地的新建据点，抽调兵力回援正太路，这对拔除鬼子深入抗日根据地的据点，起到了以优势兵力而破之的大好时机，对整个太行山根据地的巩固和建设，更加有力。

百团大战能达到这个目的，那就使八路军展开的总破袭，战果会更加丰厚，不但我军取得了作战的主动权，而且还能利用正太线，操纵华北之战局，这是目前来讲。

因为百团大战不是长久之战，只是短时间内，利用优势兵力对敌正太路展开总破袭，暂时造成敌交通线之瘫痪，而不能从根本上改变整个抗战之战局。

八路军副总指挥分析的非常到位，此时日军各部队正疯狂的向正太路集结增援，正太线各残留的日军据点，还在继续顽抗，不时的偷袭破路的抗日军民，坚守据点，作为反击八路军破袭的堡垒。

副总指挥命令各战区，以最快的速度、动员最强大的破路大军，继续完成还没有破袭的路段，拔除炮楼拆毁道轨，炸掉大桥，摧毁还存留的涵洞、车站，扩大战果，向外延出击，并抽出部分兵力，阻击扑上来的日军增援，保护破路军民的安全。

命令晋察冀军区聂部，在正太路南线，阻击增援日军，力求集中优势兵力，消灭大队以下日军，对石家庄、井陉一线，继续破袭，对平、灵、曲、定、唐等铁路外延之县城，应派出部队不断袭扰之。

八路军前指副总指挥，对百团大战所部署的第一阶段后期任务，以及第二阶段的行动方案，是具有前瞻性、是主动进攻性的计划，充分体现了八路军总部的抗日决心和坚强意志，充满了驾驭战局的雄心。

为了顺利实施下阶段任务，八路军总部在九月二日，向各作战兵团，发出《敌援正太兵力已到我执行第二步方针》的电报。

电报中明确指出：连日有晋南往援正太路之敌、约一旅团之兵力，其先头已达正太路西段。榆次、卢家庄、寿阳之敌向外扩张，已夺回不少据点，井陉、石家庄等沿线集敌五六千，后续会可能增加，娘子关、阳泉之敌异动，向东西扩张，估计敌正图东、西夹击我军。

正太路已取得很大胜利，......，聂兵团继续扩大成果亦不可能，决心按第三号电令第二部行动之方针，力求乘正太路我军民破袭后，敌部已转移兵力之有利时机，完成第二步计划之任务。

针对正太路总破袭战第一阶段后期，各战区作战区域所发生的敌我局势的转变，八路军延安总部发出《关于击敌的军事行动指示》，要求各兵团应集中力量打击敌人。

并指出应依照华北我八路军百团大战战役之先例，在山东及华中组织一次及多次对敌进攻行动，华北百团大战战役，应扩大战果，达到狠狠打击敌人之目的。

晋察冀军区接到总部前指及延安总部指示，命令各部队在进入第一阶段后期，扩大战果，在外延突袭敌据点，骚扰日军、占领中小县城，并抓紧时间部队休整。

聂司令对各部队所取得的辉煌战果，怕干部战士倨傲轻敌，一再嘱托道：“决不能因胜利而麻痹，因疲劳而松懈，因部队伤亡而沉迷，要提高部队战斗力，掩护破路数万抗日军民的安全，这是每一名指挥员，应该警惕或引起重视的大事。”