DATA1数码兽一天，现实世界的电脑中持有人工智能的病毒扩散开来，这种病毒在网络上滋生质变成生物进化成为DigitalMonster（通称DIGIMON）。掌管数码兽一切的数码核，是一种作为生命体的程序和数据(0和1的数字或记号的集合)。在人类眼中看到的怪兽或半机械之类的形态，全部都是根据数码核内的信息所决定的。

DATA2进化数码兽是从数码蛋中诞生的，它们吸取资料或者战斗吸取对方的资料，到一定程度就会改变形态的过程叫做数码兽的“进化”。最后生命结束后，又再次变成数码蛋。数码兽的进化是分等级的，分别是“幼年期”“成长期”“成熟期”“完全体”和“究极体”，最高的当然是究极体是最高形态。拥有强大力量的究极体数码兽在现实世界的网络拥有强大的武器！

DATA3数码世界(DW)数码兽所生存世界叫数码世界（DigitalWorld），它由谜一样的主机Yggdrasil直接管理。另一说，数码兽是Yggdrasil在数码世界进行实验而产生的生命体！数码兽们的资料容量大大超过了Yggdrasil的预料，数码世界面临巨大化宇宙规模的膨胀，数码世界的危机迫在眉睫！再这样下去，数码世界一定会崩溃的！

数码兽的特征“进化”是一口气增加数据，使其形态发生改变。加上网络互通，把数码世界以外数据流入，使数码兽能不规则进化。这样日积月累，数码世界可用率急速下降！

这个计划名叫“方舟计划”，它执行使超过负荷的数码兽全部删除，把必要的“皇家骑士（RoyalKnight）”及部份研究对象上传到了新的数码世界……PS:除了天使之城的数码兽与皇家骑士被选中的话，其余数码兽都会因为方舟计划被删除